5月30日
15:30～17:00
岩崎 信太郎
理化学研究所 開拓研究本部 岩崎RNAシステム生化学研究室 主任研究員
東京大学 新領域創成科学研究科 メディカル情報生命専攻 客員准教授
リボソームプロファイリングの最新技法
Advanced tricks in ribosome profiling
翻訳調節は、遺伝子発現の多様化や細胞内外の環境応答として極めて重要な役割を果たしている。リボソームプロファイリング（またはRibo-Seq）は、細胞内翻訳を高感度、定量的、包括的、に解析する手法として広く使われている。しかし、現在の手法で、大量のsampleが必要であること、多検体を同時解析できないこと、あるいは翻訳の絶対定量、といった点で大きな問題がある。これらの問題を克服するために、我々は最近、リボソーム・プロファイリングのいくつかの新しい派生技術を開発した。これらの未発表の最新手法について紹介する。
Translation regulation plays a pivotal role in the diversification of gene expression and the response to intra- and extracellular environmental cues. Ribosome profiling (or Ribo-Seq) serves as a sensitive, quantitative, comprehensive, and data-rich technique to survey ribosome traversal across the cellular transcriptome. However, the current method has substantial issues, such as a large quantity of input material, sample scalability, and data calibration. To overcome these issues, we recently developed several new derivatives of ribosome profiling. I will present the unpublished advances of the techniques.
Translation regulation plays a pivotal role in the diversification of gene expression and the response to intra- and extracellular environmental cues. Ribosome profiling (or Ribo-Seq) serves as a sensitive, quantitative, comprehensive, and data-rich technique to survey ribosome traversal across the cellular transcriptome. However, the current method has substantial issues, such as a large quantity of input material, sample scalability, and data calibration. To overcome these issues, we recently developed several new derivatives of ribosome profiling. I will present the unpublished advances of the techniques.
岩崎 信太郎
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